Članstvom u SKDD-u omogućava se korištenje usluga koje SKDD nudi članovima. Postoje dvije vrste članova SKDD-a: članovi depozitorija i članovi sudionici. Članovima SKDD-a mogu postati svi izdavatelji i drugi subjekti određeni Zakonom o tržištu kapitala koji udovoljavaju uvjetima za primitak u članstvo koje određuje SKDD.
Izdavatelji vrijednosnih papira mogu postati članovima depozitorija. Članovi depozitorija imaju pristup uslugama depozitorija koje uključuju i provođenje korporativnih akcija. Prava i obveze SKDD-a i članova depozitorija utvrđuju se Pravilima i Uputom te ugovorom o članstvu između SKDD-a i člana depozitorija.
Članovi sudionici imaju pristup uslugama depozitorija i uslugama poravnanja i namire. Prava i obveze SKDD-a i člana sudionika utvrđuju se Pravilima, Uputom te ugovorom o članstvu između SKDD-a i člana sudionika.